Soy estudiante de ing de sistemas y weno tengo un problema no se en que puedo programar este aplicativo, es cun aplicativo que debe administrar archivos o mejor dicho actualizarlos o carpetas tmb, el problemas es qeu debe ser un aplicativo de escritorio en windows que aparesca en la parte inferior derecha que se inicie cuando insertas un dispositivo USB y actualize una estructura de carpetas predefinida de la memoria USB al disco duro, muchas gracias no se como empesar en que puedo programarlo.

No mencionas nada acerca del lenguage de programación que usas.

Bueno, para lo que quieres hacer pienso que la mejor opción es usar WMI.

Puedes suscribir eventos de WMI desde cualquier lenguaje de programación:

http://dotnetslackers.com/community/blogs/basharkokash/archive/2008/02/06/usb-port-insert-remove-detection-using-wmi.aspx
http://karlagius.com/2009/03/04/keeping-track-of-usb-devices-using-wmi/